Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
GTF2IP78347 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
GTF2IP78347 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms