Protein–RNA interactions for Protein: P68133

ACTA1, Actin, alpha skeletal muscle, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTA1P68133 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
ACTA1P68133 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PEX7-202ENST00000367756 680 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ACTA1P68133 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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