Protein–RNA interactions for Protein: P61968

LMO4, LIM domain transcription factor LMO4, humanhuman

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Length 165 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO4P61968 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
LMO4P61968 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
LMO4P61968 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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