Protein–RNA interactions for Protein: P59780

AP3S2, AP-3 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3S2P59780 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PGPEP1L-201ENST00000378919 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
AP3S2P59780 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78 ms