Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
CTBP2P56545 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms