Protein–RNA interactions for Protein: P56180

TPTE, Putative tyrosine-protein phosphatase TPTE, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPTEP56180 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TPTEP56180 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 COPS7B-206ENST00000410017 2051 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TPTEP56180 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
TPTEP56180 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
TPTEP56180 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms