Protein–RNA interactions for Protein: P54198

HIRA, Protein HIRA, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,017 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRAP54198 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HIRAP54198 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
HIRAP54198 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 GUK1-210ENST00000391865 990 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
HIRAP54198 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.9 ms