Protein–RNA interactions for Protein: P53680

AP2S1, AP-2 complex subunit sigma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP2S1P53680 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
AP2S1P53680 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
AP2S1P53680 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms