Protein–RNA interactions for Protein: P51398

DAP3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DAP3P51398 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
DAP3P51398 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
DAP3P51398 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ACSL4-201ENST00000340800 5333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
DAP3P51398 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms