Protein–RNA interactions for Protein: P49221

TGM4, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase 4, humanhuman

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM4P49221 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
TGM4P49221 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms