Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
UTRNP46939 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UTRNP46939 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ST7-OT4-203ENST00000466018 894 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
UTRNP46939 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 ME2-218ENST00000640965 2476 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 GPR182-203ENST00000622922 591 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
UTRNP46939 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
UTRNP46939 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UTRNP46939 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms