Protein–RNA interactions for Protein: P45379

TNNT2, Troponin T, cardiac muscle, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT2P45379 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TNNT2P45379 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms