Protein–RNA interactions for Protein: P43354

NR4A2, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A2P43354 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
NR4A2P43354 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
NR4A2P43354 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms