Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
GJC1P36383 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.89■□□□□ 0.62
GJC1P36383 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJC1P36383 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJC1P36383 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJC1P36383 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
GJC1P36383 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
GJC1P36383 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms