Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
PTPN7P35236 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PTPN7P35236 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.8 ms