Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL9P32969 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL9P32969 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms