Protein–RNA interactions for Protein: P31327

CPS1, Carbamoyl-phosphate synthase [ammonia], mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPS1P31327 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CPS1P31327 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CPS1P31327 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CPS1P31327 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CPS1P31327 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CPS1P31327 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 COQ6-210ENST00000554920 649 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CPS1P31327 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms