Protein–RNA interactions for Protein: P30622

CLIP1, CAP-Gly domain-containing linker protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIP1P30622 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HCG15-203ENST00000438190 1032 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CLIP1P30622 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.1 ms