Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 ZNF517-202ENST00000525105 1383 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GTF2E1P29083 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms