Protein–RNA interactions for Protein: P28223

HTR2A, 5-hydroxytryptamine receptor 2A, humanhuman

Predictions only

Length 471 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR2AP28223 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
HTR2AP28223 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms