Protein–RNA interactions for Protein: P21579

SYT1, Synaptotagmin-1, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYT1P21579 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SYT1P21579 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SYT1P21579 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SYT1P21579 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT1P21579 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT1P21579 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SYT1P21579 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
SYT1P21579 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
SYT1P21579 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms