Protein–RNA interactions for Protein: P15924

DSP, Desmoplakin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSPP15924 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 ZDHHC4-203ENST00000396707 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
DSPP15924 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 IFT20-203ENST00000395418 825 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 IFT20-216ENST00000588477 774 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
DSPP15924 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 AL645941.1-201ENST00000415875 338 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
DSPP15924 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms