Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
IRF1P10914 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms