Protein–RNA interactions for Protein: P10072

HKR1, Krueppel-related zinc finger protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HKR1P10072 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
HKR1P10072 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms