Protein–RNA interactions for Protein: P0DPA2

VSIG8, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG8P0DPA2 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
VSIG8P0DPA2 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VSIG8P0DPA2 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.3 ms