Protein–RNA interactions for Protein: P0CJ89

DUX4L6, Double homeobox protein 4-like protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX4L6P0CJ89 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 VWF-201ENST00000261405 8838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
DUX4L6P0CJ89 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms