Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
NGFRP08138 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
NGFRP08138 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NGFRP08138 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NGFRP08138 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
NGFRP08138 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 EVX2-201ENST00000308618 4203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms