Protein–RNA interactions for Protein: P04141

CSF2, Granulocyte-macrophage colony-stimulating factor, humanhuman

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF2P04141 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CSF2P04141 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CSF2P04141 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CSF2P04141 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 INTS10-201ENST00000397977 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CSF2P04141 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CSF2P04141 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms