Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

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Length 160 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
SFT2D2O95562 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
SFT2D2O95562 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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