Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC35.14■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.22
ABCC9O60706 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC239798.4-201ENST00000609879 700 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC35.13■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC35.12■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NTNG1-203ENST00000370066 1443 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 Z94721.1-201ENST00000444102 385 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
ABCC9O60706 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88 ms