Protein–RNA interactions for Protein: O60437

PPL, Periplakin, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPLO60437 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPLO60437 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPLO60437 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPLO60437 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPLO60437 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPLO60437 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPLO60437 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms