Protein–RNA interactions for Protein: O43861

ATP9B, Probable phospholipid-transporting ATPase IIB, humanhuman

Predictions only

Length 1,147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP9BO43861 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ATP9BO43861 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ATP9BO43861 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms