Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
DENRO43583 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
DENRO43583 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC104640.1-201ENST00000562617 2109 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
DENRO43583 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DENRO43583 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms