Protein–RNA interactions for Protein: O43189

PHF1, PHD finger protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF1O43189 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PHF1O43189 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PHF1O43189 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms