Protein–RNA interactions for Protein: O15360

FANCA, Fanconi anemia group A protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCAO15360 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
FANCAO15360 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
FANCAO15360 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FANCAO15360 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FANCAO15360 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms