Protein–RNA interactions for Protein: O15160

POLR1C, DNA-directed RNA polymerases I and III subunit RPAC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1CO15160 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HOXB-AS2-201ENST00000464382 845 ntTSL 4 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZYG11A-203ENST00000612017 3682 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
POLR1CO15160 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
POLR1CO15160 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms