Protein–RNA interactions for Protein: O00468

AGRN, Agrin, humanhuman

Predictions only

Length 2,067 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGRNO00468 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
AGRNO00468 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
AGRNO00468 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
AGRNO00468 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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