Protein–RNA interactions for Protein: K7ER74

APOC4-APOC2, APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2K7ER74 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
APOC4-APOC2K7ER74 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
APOC4-APOC2K7ER74 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms