Protein–RNA interactions for Protein: H3BQZ7

HNRNPUL2-BSCL2, HCG2044799, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 746 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms