Protein–RNA interactions for Protein: E9PKD4

NPIPA5, Nuclear pore complex-interacting protein family member A5, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPIPA5E9PKD4 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NPIPA5E9PKD4 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms