Protein–RNA interactions for Protein: B4DXG7

cDNA FLJ57652, highly similar to Ephrin-A3, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B4DXG7 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
B4DXG7 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
B4DXG7 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 ADGRG2-209ENST00000379876 4779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
B4DXG7 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
B4DXG7 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
B4DXG7 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms