Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SOBPA7XYQ1 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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