Protein–RNA interactions for Protein: A6NK06

ACOD1, Cis-aconitate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACOD1A6NK06 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
ACOD1A6NK06 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms