Protein–RNA interactions for Protein: A6NFR6

C5orf60, Putative uncharacterized protein C5orf60, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C5orf60A6NFR6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
C5orf60A6NFR6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms