Protein–RNA interactions for Protein: A6NCW7

USP17L4, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 4, humanhuman

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Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L4A6NCW7 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC074135.2-201ENST00000600896 510 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
USP17L4A6NCW7 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 YWHAZ-203ENST00000395951 964 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MCF2L-AS1-201ENST00000446789 712 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
USP17L4A6NCW7 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
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