Protein–RNA interactions for Protein: A5D8W1

CFAP69, Cilia- and flagella-associated protein 69, humanhuman

Predictions only

Length 941 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP69A5D8W1 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CFAP69A5D8W1 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC112907.2-201ENST00000448639 330 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CFAP69A5D8W1 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms