Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC005034.1-201ENST00000426657 489 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 DISC1-202ENST00000317586 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
NCOA3Q9Y6Q9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.6 ms