Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PPP1R36-201ENST00000298705 1405 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 OTUD3-201ENST00000375120 6397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HNRNPUL1-204ENST00000392006 3555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NLRP13-201ENST00000342929 3132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DYNLL2-201ENST00000579991 6805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GHDC-203ENST00000428494 2518 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PAX2-202ENST00000361791 3193 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TNXB-209ENST00000613214 6842 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms