Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3E1

HDGFL3, Hepatoma-derived growth factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDGFL3Q9Y3E1 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
HDGFL3Q9Y3E1 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
HDGFL3Q9Y3E1 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms