Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y282

ERGIC3, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC3Q9Y282 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ERGIC3Q9Y282 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms